Основной экипаж ТПК «Союз МС-02» в составе космонавтов Роскосмоса Сергея Рыжикова, Андрея Борисенко и астронавта НАСА Роберта Шейна Кимброу и их дублёры – космонавты Роскосмоса Александр Мисуркин, Николай Тихонов и астронавт НАСА Марк Ванде Хай прибыли на космодром Байконур для завершения предстартовой подготовки.

8 октября 2016 года запланирована повторная «первая тренировка» экипажей в ТПК «Союз МС-02». Также 7 и 8 октября запланировано проведение инструктажа по проверке средств связи во время тренировки, медицинские мероприятия и физическая подготовка.

6 октября 2016 года Государственная комиссия приняла решение о новой дате запуска пилотируемого корабля «Союз МС» – 19 октября. Ранее пуск «Союз МС-02» был отложен из-за выявленной в ходе подготовки корабля неисправности кабеля в системе управления спускаемого аппарата. Кабель был заменён, корабль прошёл серию дополнительных проверок. В это время члены экипажей продолжили тренировки в Центре подготовки космонавтов в подмосковном Звёздном городке.